La necesidad de publicar las obras ganadoras del Premio Literario Casa de las Américas motivó la creación de la Editorial en 1960. Posteriormente, sus objetivos se fueron ampliando hacia la promoción de la literatura más importante y representativa de la América Latina y el Caribe. El nombre actual, Fondo Editorial Casa de las Américas, lo asumió en 1997.

En 1962 existían las colecciones Premio y Cuadernos Casa; en 1963, aparece Literatura Latinoamericana, dedicada a los clásicos, y al año siguiente Estudios Monográficos y Nuestros Países. En 1967 se introduce La Honda, destinada a las obras literarias de más reciente creación, y dos años después, Valoración Múltiple, que recoge textos críticos sobre autores, movimientos o tendencias de las letras del Continente; en 1971 aparece Pensamiento de nuestra América; en 1979, Investigaciones; en 1981, Premio de Musicología; Premio de Fotografía, en 1983; Colibrí, de literatura infantil, en 1985; los Cuadernos de La Honda, en 1988; los Cuadernos del Premio se inician en 1989. La colección más reciente, Pasamanos, que se estrena en 2001, publica textos breves de autores internacionalmente reconocidos.